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(记者 陈坚) 最近,之江实验室生命科学计算研究中心高级研究专员黄柏成很是兴奋。得益于实验室生命科学计算开放平台最新推出的CRISPR核酸检测设计算法模型,黄柏成团队及团队成员将人乳头瘤病毒(HPV)分型检测试剂盒的研发周期从3个月以上缩短到了1-2周,大幅提升了实验效率和质量,为医学临床提供快速可靠的病原学诊断参考。
这个立下“汗马功劳”的计算平台,由实验室生命科学计算研究中心自主开发,同步提供数据服务、计算服务、实验管理服务等功能。截至目前,在平台上完成各类任务的总数已超过34万个。
该平台拥有一个百亿参数规模的蛋白语言模型和相应的生命科学算法分析工具。前者是基于6亿条蛋白语句、利用深度学习技术自主训练出的基座模型,能够“解码”生命语言,创造全新的蛋白质,为生命科学研究机构和医疗企业等提供计算服务;后者包含20余种算法工具,性能达到国际领先水平,并被国内外数百个合作伙伴采用。
在生命科学计算开放平台“诞生”之前,黄柏成笑言自己的研究更像是“农耕时代的手工作坊”。“以往的核酸检测研究中,我们一般采用‘穷尽式筛选’方式,通过湿实验从成百上千的候选核酸序列中‘手工’比对筛选出最优引导序列,周期长,耗费了大量的人力和财力。同时,传统病毒核酸检测需要配备核酸扩增仪等专业设备及其操作环境,造价比较高。”黄柏成告诉记者。
生命科学计算研究中心工程专家郭玲介绍,团队运用了IT(计算科学)和BT(生命科学)融合的方法,通过“计算+数据+模型”方式,依托高质量湿实验数据集和算法的力量,构建优选模型来模拟基于CRISPR的病毒检测靶标核酸序列和候选引导序列的结合效应,从海量的候选序列中筛选出检测用引导序列的“最优解”。
“智能计算赋能生命科学研究,为我们至少节约了90%以上的研发时间,极大地加速了研发进程,也使产品能够尽快落地。”郭玲告诉记者,该试剂盒的检测范围覆盖了6种HPV主要高危亚型,未来将继续依靠智能计算的强大力量,结合临床需求,进一步拓展亚型检测范围,最终达到全面、精准、快速检测病毒的目标。
据了解,生命科学计算开放平台已支撑上海科技大学、南京师范大学、浙江大学等高校的科研工作,为PET塑料降解酶、苹果酸脱氢酶、广谱抗菌肽等研究提供计算方法。接下来,该平台将继续牵引生命科学研究范式由实验筛选转为生成论证,大幅提升生命科学创新效率、降低创新成本,助力生命健康产业应用生态繁荣。
近水楼台先得月。近年来,余杭区创新综合实力持续攀升,连续四年荣膺全省“科技创新鼎”。以超常规力度推进重大创新平台建设,四大省实验室、超重力大科学装置、深时数字地球国际大科学计划等科研载体先后落地,科研重器成集群发展之势。
今年2月底,余杭发布“玉鸟计划”和《余杭区构筑科技成果转移转化首选地行动计划》,核心是构建完善以人才驱动为内核,科研侧、企业侧双向奔赴,园区、平台、金融、服务四位一体,形成“一心两翼双向四方”的科技成果转化服务体系,重点实施科技成果引育工程、项目落地攻坚工程等6大工程,打造科技成果转化首选地。
今年5月,余杭重磅发布加快建设“环之江实验室创新生态圈”行动方案,旨在以科技创新和成果转化为发展主线,构建“一心一湖一路”空间格局、打造“两大三层多群”创新生态、完善“1+2+N”产业培育体系(1个核心领域:智能计算;2大重点支撑:AI芯片+大模型;N个“AI+”应用场景),以之江实验室在智能计算领域“算力、模型、数据”的核心优势,加速形成以之江实验室为引擎的“创新平台+孵化器+特色小镇+产业集群”创新生态圈,加快培育新质生产力,为推动余杭高质量发展注入强劲动能。今年上半年,全区实现技术交易额154.7亿元,总量居全市第一。
为全力服务保障浙江新型算力中心建设,目前余杭正加快推进“万卡千星”重点工程,首期千卡集群已点亮,计划8月底实现基础万卡集群整体点亮。为提升辐射带动力,深化政产学研合作,配套设立之科成果转化基金,首期规模5亿元。
同时,进一步强化科技成果落地保障和就地转化空间保障,出台“新质生产力20条”“低空经济18条”等创新政策,鼓励企业抢占人工智能、低空经济等未来产业制高点,推动“智力”变“生产力”。今年已兑现各类惠企资金56.14亿元,总额全市第一。
如果说“从0到1”代表科技创新的原始突破,那科技成果转化进入市场就是“从1到∞”的路径演进。
察势者智,驭势者赢。余杭有优质的源头供给和服务保障,也有构建高标准、高效率的技术市场服务体系,更有优惠政策促进成果供需精准匹配,相信会有越来越多的优质科技成果从“书架”走向“货架”。